К основным причинам бесплодия женщин можно отнести аномалии и пороки развития женского полового аппарата; воспалительные заболевания органов малого таза; эндокринные нарушения; иммунологические факторы; эндометриоз; туберкулез женских половых органов; психические или неврологические расстройства; генные, хромосомные нарушения; производственные и бытовые интоксикации; применение нерациональной терапии и некоторых лекарств, отрицательно действующих на процесс зачатия или оказывающих тератогенное действие на плод. В ряде случаев точных данных об этиологии бесплодия нет (труднообъяснимые случаи бесплодия). У большинства таких женщин не обнаружены явные причины, препятствующие наступлению беременности.
Бесплодие у женщин может быть физиологическим — обусловленным отсутствием овуляции в детском и старческом возрасте, в периоде лактации. Имеются данные, позволяющие утверждать, что значительные отклонения в физиологических функциях организма могут быть вызваны психогенными факторами. В качестве примера можно привести случаи нарушений овуляции у больных с анорексией психогенного происхождения, у которых овуляция восстанавливается после излечения от анорексии.